Abstrak
Kami mengevaluasi 4.512 produk alami dari pustaka ConMedNP dan SANCDB untuk mengidentifikasi potensi penghambat Plasmodium falciparum L-lactate dehydrogenase (PfLDH) dengan mempertimbangkan proses penyaringan virtual. Penyaringan virtual dengan presisi ekstra memungkinkan pemeringkatan seratus molekul hit teratas berdasarkan sifat docking-nya. Hit yang dipilih selanjutnya dipersingkat berdasarkan parameter docking dan MMGBSA dibandingkan dengan referensi. Hasilnya, empat hit dipilih: Mol1, Mol2, Mol3, dan Mol4, semuanya dari keluarga kalkon dan kuinon. Molekul-molekul ini menunjukkan sifat ADMET yang diprediksi dengan baik. Akhirnya, hasil simulasi dinamika molekuler menunjukkan bahwa ketiga kalkon, Mol1-4, membentuk ikatan-H, interaksi hidrofobik dengan asam amino utama di situs aktif. Studi in silico ini menunjukkan bahwa senyawa kalkon dapat berfungsi sebagai sumber potensial untuk mengembangkan obat antimalaria baru yang efektif untuk memerangi malaria. Studi in vitro atau in vivo lebih lanjut dapat dilakukan untuk menentukan efektivitasnya yang sebenarnya.
Identifikasi Inhibitor Potensial Plasmodium falciparum L-lactate dehydrogenase (PfLDH) dari Perpustakaan Senyawa Terpilih di Afrika: Skrining Virtual, MM-GBSA, dan Studi Dinamika Molekuler
