Abstrak
LATAR BELAKANG
Dendrothrips minowai Priesner, hama penting di daerah penghasil teh di Asia, khususnya Cina, merusak tanaman teh ( Camellia sinensis ) dengan memakan daunnya yang masih muda dan kaya akan polifenol. Tujuh genom yang telah dirakit dari ordo Thysanoptera saat ini tersedia.
HASIL
Studi ini menyajikan perakitan genom tingkat kromosom pertama dari D. minowai yang dihasilkan oleh PacBio Revio, Oxford Nanopore Technologies, MGI, dan teknologi Hi-C. Genom yang dirakit berukuran 350,11 Mb dengan 1269 contig dengan contig N50 sebesar 536,34 Kb dan N50 scaffold sebesar 16,86 Mb, yang disusun melintasi 19 kromosom. Sebanyak 16.730 gen penyandi protein diidentifikasi, dengan 92,28% dianotasi secara fungsional. Analisis filogenetik mengungkapkan bahwa D. minowai bercabang sekitar 103,2 juta tahun yang lalu, mendahului semua genom spesies Thripidae yang dilaporkan. Analisis genomik komparatif mengidentifikasi 12 famili gen yang diperluas dan 172 yang dikontrak dari D. minowai , dengan famili gen yang diperluas terkait dengan pemrosesan metabolit tanaman inang dan enzim detoksifikasi. Selain itu, thrips oligofagus, D. minowai dan Stenchaetothrips biformis , memiliki lebih sedikit gen kemosensori (reseptor pengecap, reseptor odoran, reseptor ionotropik, protein kemosensori, dan protein pengikat odoran) dan gen detoksifikasi (P450, karboksil/kolinesterase, UDP-glikosiltransferase) daripada spesies polifagus ( Frankliniella occidentalis dan Thrips palmi ). Menariknya, D. minowai menunjukkan perluasan dalam famili transporter ABC, khususnya ABCG dan ABCC, yang mungkin penting untuk mendetoksifikasi kandungan polifenol yang tinggi dalam tanaman teh.
KESIMPULAN
Studi ini menyediakan urutan genom lain untuk spesies thrips oligofagus, yang memperkaya data genom untuk studi lebih lanjut tentang evolusi, adaptasi inang, dan strategi pengendalian baru thrips. © 2025 Society of Chemical Industry.
